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但胶原蛋白的种类要少得多,已从鱼类中分离鉴定出的胶原类型有:广泛分布在真皮、骨、鳞、鳔、肌肉等处的I型、和脊索的Ⅱ型和Ⅺ型以及肌肉的V型。而鱼皮和鱼骨所含的Ⅰ型胶原蛋白是其主要胶原蛋白。
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并进一步利用Sephacryl S-300 HR凝胶过滤和DEAE-52阴离子交换除去多糖,获取胶原蛋白纯品。SDS-PAGE电泳表明胶原分子的组成为(α1)3,且α链类似于脊椎动物Ⅰ型胶原的α1链,热收缩温度为57℃,低于牛皮胶原5℃。
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胶原蛋白的水解产物含有多种氨基酸,其中以甘氨酸为丰富。其次为丙氨酸、谷氨酸和精氨酸,半胱氨酸、色氨酸、酪氨酸以及蛋氨酸等必需氨基酸含量低,因此,胶原蛋白属不完全蛋白质。水解猪皮胶原所得的肽类产物中含有19种氨基酸。